Filtres Waterra ADN environnemental pour l’échantillonnage de l’eau

Les filtres Waterra ADN environnemental sont fabriqués dans notre salle blanche à Calgary, en Alberta, Canada. Chaque filtre est ensaché individuellement avec deux embouts pour contenir un tampon pour la conservation des échantillons. Le média filtrant est disponible en 5 tailles de pores différentes de 0,1 à 5 microns et offert en formats de 300 et 600 centimètres carrés.

Informations générales

Il existe un intérêt à interroger certains plans d’eau de surface quant à la présence de certains organismes. Peut-être qu’une espèce envahissante a été remarquée et que l’on veut déterminer sa présence. Les plans d’eau de surface tels que les étangs, les ruisseaux et les lacs peuvent être échantillonnés à l’aide de filtres Waterra ADN environnemental en pompant l’eau de ce plan à travers le filtre. L’ADN dans l’eau est capturé par le filtre et peut être conservé pour extraction en laboratoire.

Le « e » dans ADN environnemental signifie environnemental et « ADN » est l’acide désoxyribonucléique, bien connu pour être l’élément constitutif de la vie. L’ADN est contenu dans les cellules de chaque organisme vivant et est rejeté dans l’environnement de nombreuses façons. L’organisme peut vivre ou avoir vécu dans le plan d’eau ou le bassin versant, y passait ou y a été transporté. Indépendamment de la façon dont il y est arrivé, s’il est dans l’eau, il y a une chance que l’ADN soit dans l’échantillon d’eau traité à travers le filtre ADN environnemental.

Un avantage de l’utilisation des filtres Waterra ADN environnemental est que la grande surface du filtre (soit 300 cm² ou 600 cm²) permet de faire passer de grands volumes d’eau. Les échantillons jusqu’à 100 litres ou plus, selon la turbidité de l’eau, augmentent les chances de capturer l’ADN environnemental de l’espèce cible. Le traitement de grands échantillons devient difficile à moins d’utiliser une pompe.

Techniques de collecte d’échantillons :

Branchez simplement un filtre Waterra ADN environnemental dans le tube de votre pompe d’aspiration et placez l’extrémité d’entrée du filtre dans le plan d’eau à échantillonner. Faites passer le volume d’eau désigné à travers le filtre jetable en ligne, capturant les particules, y compris l’ADN environnemental, dans le filtre.

Waterra offre des pompes péristaltiques à piles qui ont été conçues pour une utilisation sur le terrain. Nous recommandons que le tube péristaltique soit connecté à une autre longueur de tube LDPE ou HDPE qui, à son tour, a un filtre installé à l’extrémité. En connectant le filtre à l’extrémité d’admission, la longueur du tube PE et le tube péristaltique lui-même n’entrent pas en contact avec l’ADN environnemental capturé. Cela atténue la nécessité de changer le tube pour chaque échantillon.

Si cela n’est pas pratique, le filtre peut être inséré entre le tube péristaltique et une longueur de tube jetable qui devrait être changée après chaque emplacement d’échantillon. Waterra offre un système complet de pompe, de tube et de filtres ADN environnemental pour un tel échantillonnage.

Une fois le volume désiré traité, le filtre est soigneusement drainé du côté de la sortie afin de ne pas perdre les particules capturées dans le filtre. Une solution tampon est généralement ajoutée pour conserver l’ADN environnemental, bien que la congélation et le séchage soient d’autres méthodes de conservation. (Veuillez noter que Waterra ne fournit pas de solutions tampons). Fixez hermétiquement un embout tampon sur le côté de l’entrée. Remplissez le filtre avec le tampon désiré pour conserver l’ADN et fixez le deuxième embout tampon pour piéger le tampon dans le filtre. Les bouchons d’extrémité Waterra retiennent le tampon et l’ADN environnemental pour un traitement ultérieur. Des bouchons d’extrémité sont fournis dans chaque sac de filtre ADN environnemental scellé.

Nous avons écrit un article ici publié dans Environmental Science & Engineering Magazine comme introduction au concept d’échantillonnage d’ADN environnemental avec une référence spéciale à un traité exceptionnel sur le sujet « Environmental DNA for Biodiversity Research and Monitoring » de Pierre Taberlet, Aurélie Bonin, Lucie Zinger et Eric Coissac publié par Oxford University Press en 2018.

Méthode 1 pour insérer le tampon

Méthode 2 pour insérer le tampon. Certains chercheurs trouvent cela plus efficace.